Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр по праву считается одним из крупнейших федеральных научно-лечебных учреждений Российской Федерации, оказывающих специализированную, в том числе высокотехнологичную медицинскую помощь. Сегодня ФГБУ «СЗФМИЦ» Минздрава России  — это динамично развивающееся учреждение. Последние годы стали для Центра решающими. Расширяется как научная, так и клиническая сфера деятельности: открываются новые научные подразделения, в настоящее время в Центре работают шесть научно-исследовательских институтов, в 2010 году введен в эксплуатацию перинатальный центр, в 2011, году после реконструкции, лечебно-реабилитационный комплекс, растет объем высокотехнологичной помощи. В 2014 году филиалом Центра стал Российский научно-исследовательский нейрохирургический институт им. проф. А. Л. Поленова.

Из специализированного кардиологического учреждения Федеральный Центр преобразовывается в ведущее многопрофильное. Стратегия развития Центра предполагает совершенствование научно-образовательной и инновационно-технологической инфраструктуры, которая призвана обеспечивать полный цикл трансляционных исследований в медицине. Это позволяет интегрировать Центр в международное научное сообщество и создавать системы непрерывной междисциплинарной последипломной подготовки научных и медицинских кадров.